
中國水產科學研究院長江水產研究所(以下簡稱長江所)的科研人員發現,長江野生魚腸道內微生物主要來自與魚類食性相關的環境微生物,它們大多只是匆匆過客(暫住者),和宿主形成穩定適應的常住者相比占比很低。相關研究成果近日發表于《微生物學前沿》。
為了系統理解腸道微生物和環境微生物之間的動態關系,長江所科研人員提出了一個簡化的框架來描述腸道微生物的定殖和動態。水生動物在個體發育早期,環境微生物隨水體環境和餌料一起通過攝食過程進入腸道。隨著個體發育和免疫系統建立,一小部分進入腸道的微生物和宿主之間逐漸建立協同平衡成為腸道微生物定居者,而大部分進入腸道的環境微生物只是匆匆過客,因腸道內環境及免疫過程的過濾而消失或在腸道微生物群落動態競爭演替中消失。所以在成年個體腸道中,微生物是由不斷進入腸道的環境微生物和已定居腸道的微生物組成的。
為了量化環境微生物在野生魚類腸道的定殖狀況,研究人員利用16S rRNA基因擴增子測序,對長江武漢段水體環境微生物和10種野生魚類腸道微生物的群落結構進行分析,量化環境微生物和腸道內微生物之間的關系。
結果確認,在大多數個體中,近80%的腸道微生物和水體環境微生物相同(除了鱖和短頜鱭偏低,約74%)。在約80%的個體中,95%以上的腸道微生物物種和OTU(分類操作單元)屬于過客類型。在魚類物種水平,99%以上的引入腸道的微生物物種和OTU是過客。水體環境微生物中近79%OTUs和89%物種可以被引入魚類腸道。受臨時微生物引入的驅動,具有相似棲息生境和食性的魚類具有相似的腸道微生物群落。(見習記者 荊淮僑)
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